D’une famille dont sont issus plusieurs peintres (Louis Bouvier, Paul Bouvier, Berthe Bouvier), Pierre-Eugène Bouvier se forme à l’Ecole des Beaux-Arts de Genève, de 1919 à 1922. Là, il fréquente l’atelier d’Eugène Gilliard, lui-même ancien élève de Barthélemy Menn.